Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp43Q8BUM9 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Usp43Q8BUM9 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Usp43Q8BUM9 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Usp43Q8BUM9 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Usp43Q8BUM9 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Usp43Q8BUM9 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Usp43Q8BUM9 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Usp43Q8BUM9 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Usp43Q8BUM9 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Usp43Q8BUM9 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Usp43Q8BUM9 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Usp43Q8BUM9 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Usp43Q8BUM9 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Usp43Q8BUM9 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Usp43Q8BUM9 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Usp43Q8BUM9 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Usp43Q8BUM9 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms