Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8BGC1 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8BGC1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8BGC1 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8BGC1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8BGC1 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8BGC1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8BGC1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8BGC1 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8BGC1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms