Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms