Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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TwistnbQ78WZ7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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TwistnbQ78WZ7 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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TwistnbQ78WZ7 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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TwistnbQ78WZ7 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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