Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
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