Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ssxb3Q6XAS4 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ssxb3Q6XAS4 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ssxb3Q6XAS4 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ssxb3Q6XAS4 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ssxb3Q6XAS4 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb3Q6XAS4 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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