Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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