Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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