Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Pkp4Q68FH0 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Pkp4Q68FH0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Pkp4Q68FH0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Pkp4Q68FH0 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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