Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms