Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CltcQ68FD5 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms