Protein–RNA interactions for Protein: Q64518

Atp2a3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a3Q64518 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2a3Q64518 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms