Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Trim24Q64127 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Trim24Q64127 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Trim24Q64127 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Trim24Q64127 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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Trim24Q64127 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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Trim24Q64127 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms