Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

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Length 824 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ift88Q61371 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ift88Q61371 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ift88Q61371 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ift88Q61371 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ift88Q61371 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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