Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms