Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms