Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms