Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms