Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

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Length 1,013 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Rbm44Q3V089 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Rbm44Q3V089 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Rbm44Q3V089 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm44Q3V089 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms