Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Pfdn4Q3UWL8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Pfdn4Q3UWL8 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Pfdn4Q3UWL8 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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