Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28047Q3US59 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms