Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdgfl2Q3UMU9 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdgfl2Q3UMU9 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdgfl2Q3UMU9 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdgfl2Q3UMU9 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdgfl2Q3UMU9 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdgfl2Q3UMU9 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Hdgfl2Q3UMU9 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdgfl2Q3UMU9 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdgfl2Q3UMU9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdgfl2Q3UMU9 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Hdgfl2Q3UMU9 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Hdgfl2Q3UMU9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Hdgfl2Q3UMU9 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Hdgfl2Q3UMU9 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Hdgfl2Q3UMU9 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Hdgfl2Q3UMU9 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Hdgfl2Q3UMU9 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Hdgfl2Q3UMU9 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Hdgfl2Q3UMU9 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Hdgfl2Q3UMU9 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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