Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm648Q3UJ22 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm648Q3UJ22 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm648Q3UJ22 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm648Q3UJ22 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Gm648Q3UJ22 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Gm648Q3UJ22 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Gm648Q3UJ22 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
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Gm648Q3UJ22 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Gm648Q3UJ22 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Gm648Q3UJ22 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Gm648Q3UJ22 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Gm648Q3UJ22 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm648Q3UJ22 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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