Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms