Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Lrrc58Q3UGP9 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Lrrc58Q3UGP9 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Lrrc58Q3UGP9 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Lrrc58Q3UGP9 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Lrrc58Q3UGP9 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Lrrc58Q3UGP9 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Lrrc58Q3UGP9 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Lrrc58Q3UGP9 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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