Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Nom1Q3UFM5 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms