Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Ola1-203ENSMUST00000112055 1251 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13792-201ENSMUST00000121350 423 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25843-201ENSMUST00000122582 314 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr757-ps1-201ENSMUST00000172798 413 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37850-201ENSMUST00000194573 549 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19030-201ENSMUST00000194947 552 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 1700042D02Rik-201ENSMUST00000198232 389 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Stfa2-201ENSMUST00000023619 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms