Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U595 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U595 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U595 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U595 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U595 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U595 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U595 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U595 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U595 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U595 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U595 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U595 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U595 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U595 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U595 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U595 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U595 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U595 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U595 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U595 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U595 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U595 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U595 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U595 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U595 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U595 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U595 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U595 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U595 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U595 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U595 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U595 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U595 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U595 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U595 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U595 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U595 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U595 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U595 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U595 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U595 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U595 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U595 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U595 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U595 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U595 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms