Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Rnf149Q3U2C5 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Rnf149Q3U2C5 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Rnf149Q3U2C5 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Rnf149Q3U2C5 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Rnf149Q3U2C5 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Rnf149Q3U2C5 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Rnf149Q3U2C5 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms