Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms