Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms