Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ctdnep1Q3TP92 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ctdnep1Q3TP92 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ctdnep1Q3TP92 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ctdnep1Q3TP92 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ctdnep1Q3TP92 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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