Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Usp39Q3TIX9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Usp39Q3TIX9 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Usp39Q3TIX9 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Usp39Q3TIX9 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Usp39Q3TIX9 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Usp39Q3TIX9 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Usp39Q3TIX9 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Usp39Q3TIX9 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Usp39Q3TIX9 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Usp39Q3TIX9 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Usp39Q3TIX9 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Usp39Q3TIX9 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Usp39Q3TIX9 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Usp39Q3TIX9 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Usp39Q3TIX9 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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