Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms