Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Rpusd3Q14AI6 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
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Rpusd3Q14AI6 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Rpusd3Q14AI6 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Rpusd3Q14AI6 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
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Rpusd3Q14AI6 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rpusd3Q14AI6 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms