Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms