Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms