Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde1bQ01065 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms