Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms