Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bop1P97452 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bop1P97452 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bop1P97452 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bop1P97452 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Bop1P97452 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bop1P97452 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bop1P97452 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bop1P97452 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bop1P97452 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bop1P97452 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bop1P97452 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bop1P97452 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bop1P97452 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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