Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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