Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

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Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gabpb2P81069 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gabpb2P81069 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gabpb2P81069 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gabpb2P81069 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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