Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms