Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

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Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Tp53bp1P70399 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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