Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SeboxP70368 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeboxP70368 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeboxP70368 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeboxP70368 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeboxP70368 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeboxP70368 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeboxP70368 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeboxP70368 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeboxP70368 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SeboxP70368 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeboxP70368 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeboxP70368 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeboxP70368 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeboxP70368 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeboxP70368 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeboxP70368 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeboxP70368 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeboxP70368 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeboxP70368 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeboxP70368 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeboxP70368 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeboxP70368 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeboxP70368 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SeboxP70368 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeboxP70368 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeboxP70368 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeboxP70368 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeboxP70368 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeboxP70368 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeboxP70368 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SeboxP70368 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeboxP70368 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeboxP70368 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeboxP70368 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeboxP70368 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeboxP70368 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeboxP70368 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeboxP70368 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeboxP70368 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeboxP70368 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeboxP70368 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeboxP70368 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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SeboxP70368 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms