Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P58686 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P58686 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P58686 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P58686 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P58686 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P58686 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P58686 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P58686 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P58686 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P58686 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P58686 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P58686 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P58686 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P58686 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P58686 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P58686 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P58686 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P58686 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P58686 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P58686 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P58686 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P58686 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P58686 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P58686 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P58686 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P58686 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P58686 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P58686 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P58686 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P58686 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P58686 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P58686 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P58686 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P58686 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P58686 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P58686 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P58686 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P58686 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P58686 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P58686 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P58686 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P58686 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P58686 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P58686 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P58686 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P58686 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P58686 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P58686 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P58686 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P58686 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P58686 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P58686 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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