Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SmoP56726 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SmoP56726 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SmoP56726 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SmoP56726 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SmoP56726 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SmoP56726 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SmoP56726 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SmoP56726 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SmoP56726 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SmoP56726 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SmoP56726 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SmoP56726 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SmoP56726 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SmoP56726 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SmoP56726 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SmoP56726 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SmoP56726 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SmoP56726 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SmoP56726 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SmoP56726 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SmoP56726 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SmoP56726 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SmoP56726 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SmoP56726 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SmoP56726 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SmoP56726 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SmoP56726 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SmoP56726 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SmoP56726 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SmoP56726 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SmoP56726 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SmoP56726 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SmoP56726 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SmoP56726 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SmoP56726 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SmoP56726 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SmoP56726 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SmoP56726 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SmoP56726 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SmoP56726 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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