Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp5P56399 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp5P56399 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp5P56399 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp5P56399 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp5P56399 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp5P56399 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp5P56399 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp5P56399 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp5P56399 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.3 ms