Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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