Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PctpP53808 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PctpP53808 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PctpP53808 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PctpP53808 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PctpP53808 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PctpP53808 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PctpP53808 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PctpP53808 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PctpP53808 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PctpP53808 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PctpP53808 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PctpP53808 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PctpP53808 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PctpP53808 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PctpP53808 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PctpP53808 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PctpP53808 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PctpP53808 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PctpP53808 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PctpP53808 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PctpP53808 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PctpP53808 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PctpP53808 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PctpP53808 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PctpP53808 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PctpP53808 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PctpP53808 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PctpP53808 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PctpP53808 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PctpP53808 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PctpP53808 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PctpP53808 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PctpP53808 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PctpP53808 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PctpP53808 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PctpP53808 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PctpP53808 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PctpP53808 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PctpP53808 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PctpP53808 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PctpP53808 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PctpP53808 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PctpP53808 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PctpP53808 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PctpP53808 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PctpP53808 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PctpP53808 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PctpP53808 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PctpP53808 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PctpP53808 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PctpP53808 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PctpP53808 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PctpP53808 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PctpP53808 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PctpP53808 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PctpP53808 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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PctpP53808 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PctpP53808 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PctpP53808 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PctpP53808 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PctpP53808 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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PctpP53808 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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PctpP53808 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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PctpP53808 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PctpP53808 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PctpP53808 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PctpP53808 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PctpP53808 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PctpP53808 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PctpP53808 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PctpP53808 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PctpP53808 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PctpP53808 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PctpP53808 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PctpP53808 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PctpP53808 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PctpP53808 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PctpP53808 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PctpP53808 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PctpP53808 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PctpP53808 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PctpP53808 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PctpP53808 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PctpP53808 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PctpP53808 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PctpP53808 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PctpP53808 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PctpP53808 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PctpP53808 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PctpP53808 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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